Về những vụ việc đáng tiếc xảy ra gần đây trong quan hệ hai nước, như vụ sập nhịp dẫn cầu Cần Thơ và vụ việc về Công ty PCI, Chủ tịch nước Nguyễn Minh Triết nhấn mạnh quan điểm, các cơ quan chức năng hai bên cùng nhau hợp tác giải quyết nghiêm minh, đúng pháp luật, không để một vụ việc cụ thể nào làm ảnh hưởng tới mối quan hệ Việt Nam - Nhật Bản đang phát triển tốt đẹp.
Ngày 15/12, tại Phủ Chủ tịch, tiếp cựu Thủ tướng Nhật Bản Yasuo Fukuda nhân dịp sang Việt Nam dự Kỳ họp thứ 9 Đại hội đồng Diễn đàn Nghị viện châu Á về Dân số và Phát triển (AFPPD), Chủ tịch nước Nguyễn Minh Triết nhấn mạnh, trong vụ cầu Cần Thơ, các cơ quan chức năng của Việt Nam và Nhật Bản đã hợp tác điều tra nghiêm túc, đưa ra được cách giải quyết hợp tình, hợp lý.
Đối với vụ việc Công ty Tư vấn xây dựng quốc tế Thái Bình Dương (Pacific Consultants International - PCI), Nhật Bản liên quan đến Dự án Đại lộ Đông Tây TP Hồ Chí Minh, Việt Nam sẽ tiếp tục phối hợp với chặt chẽ với Nhật Bản để sớm làm rõ các nghi vấn, xử lý vụ việc nghiêm minh, đúng pháp luật.
Chủ tịch nước tin tưởng, sự hợp tác giữa hai nước trong việc làm rõ vụ việc tại Công ty PCI sẽ giúp quan hệ hữu nghị và hợp tác giữa hai nước ngày càng thêm bền chặt.
Đồng tình với ý kiến của Chủ tịch nước Nguyễn Minh Triết về cách giải quyết các vụ việc xảy ra gần đây, cựu Thủ tướng Nhật Bản Yasuo Fukuda cho rằng sự tin cậy lẫn nhau là nền tảng phát triển quan hệ hai nước.
Ông mong muốn Ủy ban hỗn hợp phòng chống tham nhũng liên quan đến ODA của Nhật Bản tại Việt Nam sẽ sớm đưa ra biện pháp nhằm ngăn chặn các vụ việc tương tự vụ việc xảy ra tại Công ty PCI.
Trên cơ sở đó, cựu Thủ tướng Nhật Bản tin rằng Chính phủ Nhật Bản sẽ sớm nối lại nguồn vốn ODA đối với Việt Nam.
Cựu Thủ tướng Nhật Bản cũng ủng hộ và bày tỏ vui mừng về tiến độ triển khai 3 dự án lớn mà Nhật Bản đã ký với Việt Nam là Dự án Khu công nghệ cao Hòa Lạc, đường sắt cao tốc Bắc - Nam, đường bộ cao tốc Bắc - Nam.
Hiện quan hệ hữu nghị và hợp tác nhiều mặt Việt Nam - Nhật Bản đang phát triển hết sức tốt đẹp.
Năm 2008, hai nước kỷ niệm 35 năm thiết lập quan hệ ngoại giao với nhiều hoạt động giao lưu, nổi bật là Đại nhạc hội Việt - Nhật tại Việt Nam và Tuần lễ Việt Nam 2008 tại Nhật Bản.
Sắp tới, hai nước sẽ ký Hiệp định Đối tác kinh tế (EPA), hướng tới mục tiêu tạo nên sự liên thông thuận lợi về hàng hóa, vốn, công nghệ và lao động có tay nghề của hai nước, nâng cao năng lực cạnh tranh của hai nền kinh tế trong khu vực và trên thế giới.
Nhật Bản hiện là nhà đầu tư, bạn hàng thương mại hàng đầu của Việt Nam với kim ngạch hai chiều năm 2007 tăng 23%, năm 2008 dự kiến đạt 17 tỷ USD, tăng 40%...